Rujan nije dobio ime po rujnom vinu, kako se obično misli, niti po kojoj drugoj jesenskoj blagodati. Ime mu dolazi od glagola "rjati" koji označava glasanje jelena i ostalih životinja koje u rujnu započinju svoju ljubavnu igru.

U narodu za mjesec rujan još postoje nazivi: malomešnjak ( po blagdanu Male Gospe, 8. rujna ), rujen, jesenščak.